Los anisáquidos usan invertebrados como huéspedes paraténicos y / o intermedios como una característica básica de la transmisión larval. La larva de la tercera etapa generalmente se desarrolla en invertebrados que son presas de huéspedes paraténicos de peces. Las larvas de Contracaecum mudan dos veces dentro del huevo y eclosionan como larvas libres de la tercera etapa envueltas en la cutícula larval de la segunda etapa. Los copépodos actúan como hospedadores paraténicos u obligatorios, por lo general ingieren estas larvas L3 libres, y los peces actúan como hospedadores intermedios / paraténicos o metaparatenicos que se alimentan de copépodos infectados. Las aves que se alimentan de peces adquieren larvas L3 al ingerir peces infectados donde se convierten en larvas de cuarta etapa y adultos. Los objetivos de este trabajo fueron establecer la correspondencia específica entre las larvas de Contracaecum pelagicum L3 que parasitan la anchoaEngraulis anchoita , y los adultos que parasitan al pingüino de Magallanes, Spheniscus magellanicus, y a la pelusa imperial Phalacrocorax se atriceps mediante el uso de marcadores moleculares; y para evaluar el reclutamiento de larvas de anisakid L3 y la infección causada por la ingestión de anchoa por S. magellanicus . Dieciséis muestras de Contracaecum larvas L3 se analizaron desde E . anchoita de Bahía Engaño, Chubut, ocho nematodos adultos de S. magellanicus y seis especímenes adultos de P. atriceps, ambos de la península de Valdés, Chubut. Todos los nematodos se secuenciaron para tres genes: mitocondrial citocromo oxidasa 2 (ADNmt cox2), ARN ribosómico mitocondrial ( rrnS ) y los separadores transcritos internos (ITS-1 e ITS-2) de la región del ADN ribosómico nuclear. Los análisis filogenéticos se realizaron mediante el análisis de Parsimony Máximo (MP) por PAUP. Además, se realizaron estudios con SEM y LM en larvas L3. Todos los individuos L3 de E. anchoita , adultos de S. magellanicus y P. atriceps agrupados en el mismo clado, bien apoyados en el árbol MP inferido de los análisis de secuencias de genes mtDNA cox2 y rrnS . Además, las alineaciones de secuencias de larvas L3 y adultos de C. pelagicum aquí obtenidas en las regiones ITS-1 e ITS-2 del ADNr coincidían con las secuencias deC. pelagicum previamente depositado por nosotros en GenBank. El reclutamiento de nematodos (R o ) fue igual a 33.07 (7.20–91.14) de larvas L3 para C. pelagicum en la comida de anchoa de cada pingüino. Las topologías de árboles MP obtenidas de los genes mtDNA cox2 y rrnS demostraron que los especímenes de larvas de Contracaecum L3 de E. anchoita y C. pelagicum de S. magellanicus y de P. atriceps constituyen un clado único, bien diferenciado y respaldado por todos otros formados por el Contracaecumspp. secuenciado hasta ahora para estos genes. Los marcadores moleculares se consideran una herramienta eficaz para dilucidar la transmisión larval. El valor de reclutamiento de larvas de Contracaecum L3 mostró que muchos gusanos no pueden establecerse en el tracto digestivo de las aves, probablemente porque están por debajo de un tamaño crítico. Se necesita más trabajo para dilucidar otros factores (por ejemplo, fisiológicos, inmunológicos) que controlan las poblaciones de nematodos en el tracto digestivo de los pingüinos.